Свято-Иоанновский ставропигиальный женский монастырь был основан в 1900 году отцом Иоанном Ильичом Сергиевым (в народе Иоанном Кронштадтским) — чудотворцем, протоиереем Кронштадтского собора Андрея Первозданного. История Иоанновского монастыря началась годом ранее с основания Иоанном Кронштадтским у себя на родине в селе Сура Архангельской губернии Иоанно-Богословской общины. Именно для ее нужд было решено приобрести землю в столице и выстроить храм и часовню. Земельный участок для постройки храма на берегу реки Карповки в Петербурге был пожертвован почетным гражданином С.Г. Раменским.
В мае 1900 года состоялась закладка подворья. В сентябре началось возведение монастырского комплекса по проекту архитектора Н.Н. Никонова. Пятиглавый храм был построен в византийском стиле с романскими арками и древнерусскими куполами. Также была сооружена небольшая деревянная часовня. Строительство монастырского комплекса было завершено в 1902 году, в этом же году Иоанн Кронштадтский с согласия Синода переименовал Сурское подворье в женский монастырь во имя Святого Иоанна Рыльского.
Все постройки Иоанновского монастыря были выполнены одним архитектором — Н.Н. Никоновым, который создал целостную композицию. В монастырский комплекс вошли храм, часовня, пятиэтажный жилой дом, иконописная мастерская, лазарет, хозяйственные постройки, при этом во всех зданиях использованы идентичные мотивы в построении фасадов. Пятикупольное главное здание храма возведено в 3 этажа, на западной стороне возвысилась столпообразная колокольня с куполом, стены облицованы керамической плиткой 2 тонов. Два верхних этажа главного здания были отведены под просторный и изящно отделанный храм во имя Двенадцати Апостолов с 2 приделами (освящен 17 декабря 1902 года), в главном иконостасе которого находилась икона Казанской Божией Матери из молельной Иоанна Кронштадтского. На первом этаже главного здания была устроена церковь во имя Преподобного Иоанна Рыльского — небесного покровителя храмоздателя (освящена 17 декабря 1901 года), а под ней в полуподвальном помещении построена небольшая церковь с иконостасом из белого мрамора во имя Святого Пророка Ильи и Царицы Феодоры — небесных покровителей Иоанна Кронштадтского. Именно эта церковь стала усыпальницей отца Иоанна после его кончины 20 декабря 1908 года.
Интерьеры монастыря также были оформлены архитектором Н.Н. Никоновым, они поражали своим богатством и разнообразием. Пол храма был выложен цветными керамическими плитками в сложном узоре, окна оформлены многоцветными витражами, зал украшали двухъярусные резные дубовые иконостасы, престолы и жертвенники из белого мрамора.
В июне 1911 года на пересечении Карповки и Иоанновского переулка построили и освятили каменную часовню во имя преподобного Серафима Саровского.
В 1923 году Иоанновский монастырь по решению советской власти был закрыт, а большинство монахиней высланы в Казахстан. В 1926 году замуровали вход в усыпальницу Иоанна Кронштадтского, так как она являлась местом паломничества. В стенах монастыря долгое время находились общежития, швейные цеха, а также мелиоративный техникум.
В 1989 году монастырский комплекс был возращен Церкви, сначала его заняло подворье Пюхтицкого женского монастыря. В день рождения Иоанна Кронштадтского 1 ноября 1989 года состоялось освящение церкви во имя Преподобного Иоанна Рыльского, летом 1991 года — храма во имя Двенадцати Апостолов.
14 июня 1990 года великий чудотворец, праведный Иоанн Кронштадтский (1829-1908) был причислен к лику святых. Празднества канонизации возглавлял Святейший Патриарх Алексий II. Святой Иоанн Кронштадтский считается небесным покровителем Санкт-Петербурга, так как основная деятельность батюшки была связана непосредственно с Петербургом и Кронштадтом.
В 1992 году обитель с благословения Патриарха стала Свято-Иоанновским ставропигиальным женским монастырем.
В наши дни почти завершена реконструкция интерьеров храма, собраны кресты и иконы, пожертвованные отцу Иоанну. Воссоздана обстановка усыпальницы Иоанна Кронштадтского, в левой части храма создан мемориал игуменьи Ангелины. Среди самых ценных старых святынь — серебряный ковчег с мощами преподобных Сергия Радонежского и Александра Свирского. Среди новых святынь Иоанновского монастыря — икона Святого Преподобного Иоанна, киот с дарами со Святой Земли настоятельнице во время восстановления обители игумении Георгии. Особо стоит отметить икону Покрова Божией Матери, которая была пожертвована Иоанновскому монастырю, и чудесным образом обновилась. Сегодня Иоанновский монастырь со своими святынями стал одним из главных центров православного паломничества.
Как добраться до Иоанновского монастыря:
Свято-Иоанновский ставропигиальный женский монастырь расположен по адресу — Санкт-Петербург, набережная реки Карповки, д. 45/36. Ближайшая станция метро – «Петроградская». Можно воспользоваться маршрутными такси К222, К321, К98, автобусом №10, трамваем №40.
Службы в Иоанновском монастыре:
Богослужения в Иоанновском монастыре проводятся ежедневно в 8-30, в воскресные и праздничные дни в 9-00 и 17-00.