Иван Агапович Воронин приобрел поместье Гора-Валдай в 1886 году. В то время в купеческих семьях свято чтили и соблюдали все что было связано с христианской церковью, Иван Агапович не был исключением и решает построить в своем поместье Гора-Валдай церковь. Однако, не типичную для небольших поместий, домовую, а настоящую, большую, расчитанную на несколько сот человек, дабы она стала главной для крестьян всех окрестных деревень.
Работы над ней начинаются в 1899 году. Для воплощения своей задумки он привлекает известного в то время архитектора В.А. Косякова, известного, например, по разработанному им проекту Богоявленской церкви расположенной на Гутуевском острове. Уже в том же 1899 году Косяков разрабатывает и утверждает проект церкви Святой Троицы.
